Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z403

TMC6, Transmembrane channel-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6Q7Z403 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMC6Q7Z403 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMC6Q7Z403 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMC6Q7Z403 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMC6Q7Z403 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMC6Q7Z403 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMC6Q7Z403 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMC6Q7Z403 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMC6Q7Z403 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMC6Q7Z403 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMC6Q7Z403 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMC6Q7Z403 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMC6Q7Z403 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMC6Q7Z403 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMC6Q7Z403 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMC6Q7Z403 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMC6Q7Z403 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMC6Q7Z403 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMC6Q7Z403 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMC6Q7Z403 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMC6Q7Z403 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMC6Q7Z403 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMC6Q7Z403 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMC6Q7Z403 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMC6Q7Z403 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMC6Q7Z403 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMC6Q7Z403 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMC6Q7Z403 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMC6Q7Z403 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMC6Q7Z403 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMC6Q7Z403 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMC6Q7Z403 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMC6Q7Z403 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMC6Q7Z403 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMC6Q7Z403 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMC6Q7Z403 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMC6Q7Z403 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMC6Q7Z403 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMC6Q7Z403 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMC6Q7Z403 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMC6Q7Z403 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms