Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS6

OTOP2, Otopetrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP2Q7RTS6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTOP2Q7RTS6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms