Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
HECW1Q76N89 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
HECW1Q76N89 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
HECW1Q76N89 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
HECW1Q76N89 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
HECW1Q76N89 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
HECW1Q76N89 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
HECW1Q76N89 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
HECW1Q76N89 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC34.71■■■■□ 3.15
HECW1Q76N89 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
HECW1Q76N89 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
HECW1Q76N89 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
HECW1Q76N89 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
HECW1Q76N89 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
HECW1Q76N89 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
HECW1Q76N89 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
HECW1Q76N89 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
HECW1Q76N89 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
HECW1Q76N89 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
HECW1Q76N89 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
HECW1Q76N89 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC34.7■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC34.68■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
HECW1Q76N89 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
HECW1Q76N89 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
HECW1Q76N89 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
HECW1Q76N89 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
HECW1Q76N89 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
HECW1Q76N89 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
HECW1Q76N89 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
HECW1Q76N89 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
HECW1Q76N89 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
HECW1Q76N89 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
HECW1Q76N89 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
HECW1Q76N89 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
HECW1Q76N89 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
HECW1Q76N89 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
HECW1Q76N89 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
HECW1Q76N89 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
HECW1Q76N89 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
HECW1Q76N89 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
HECW1Q76N89 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
HECW1Q76N89 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms