Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY1

BLOC1S2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S2Q6QNY1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BLOC1S2Q6QNY1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BLOC1S2Q6QNY1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BLOC1S2Q6QNY1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
BLOC1S2Q6QNY1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BLOC1S2Q6QNY1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BLOC1S2Q6QNY1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BLOC1S2Q6QNY1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BLOC1S2Q6QNY1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BLOC1S2Q6QNY1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BLOC1S2Q6QNY1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BLOC1S2Q6QNY1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BLOC1S2Q6QNY1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BLOC1S2Q6QNY1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BLOC1S2Q6QNY1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BLOC1S2Q6QNY1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BLOC1S2Q6QNY1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BLOC1S2Q6QNY1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BLOC1S2Q6QNY1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BLOC1S2Q6QNY1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BLOC1S2Q6QNY1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BLOC1S2Q6QNY1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BLOC1S2Q6QNY1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BLOC1S2Q6QNY1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
BLOC1S2Q6QNY1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms