Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms