Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
H3F3CQ6NXT2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H3F3CQ6NXT2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms