Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRAMD4Q6IC98 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRAMD4Q6IC98 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms