Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
CARMIL2Q6F5E8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CARMIL2Q6F5E8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CARMIL2Q6F5E8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CARMIL2Q6F5E8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CARMIL2Q6F5E8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
CARMIL2Q6F5E8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CARMIL2Q6F5E8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CARMIL2Q6F5E8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CARMIL2Q6F5E8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CARMIL2Q6F5E8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
CARMIL2Q6F5E8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CARMIL2Q6F5E8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CARMIL2Q6F5E8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CARMIL2Q6F5E8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CARMIL2Q6F5E8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CARMIL2Q6F5E8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CARMIL2Q6F5E8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CARMIL2Q6F5E8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CARMIL2Q6F5E8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CARMIL2Q6F5E8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CARMIL2Q6F5E8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CARMIL2Q6F5E8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CARMIL2Q6F5E8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
CARMIL2Q6F5E8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
CARMIL2Q6F5E8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CARMIL2Q6F5E8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CARMIL2Q6F5E8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CARMIL2Q6F5E8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CARMIL2Q6F5E8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CARMIL2Q6F5E8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
CARMIL2Q6F5E8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CARMIL2Q6F5E8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CARMIL2Q6F5E8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CARMIL2Q6F5E8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CARMIL2Q6F5E8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CARMIL2Q6F5E8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CARMIL2Q6F5E8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CARMIL2Q6F5E8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CARMIL2Q6F5E8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
CARMIL2Q6F5E8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CARMIL2Q6F5E8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.26
CARMIL2Q6F5E8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CARMIL2Q6F5E8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CARMIL2Q6F5E8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CARMIL2Q6F5E8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
CARMIL2Q6F5E8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
CARMIL2Q6F5E8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CARMIL2Q6F5E8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
CARMIL2Q6F5E8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CARMIL2Q6F5E8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CARMIL2Q6F5E8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CARMIL2Q6F5E8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CARMIL2Q6F5E8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CARMIL2Q6F5E8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CARMIL2Q6F5E8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CARMIL2Q6F5E8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CARMIL2Q6F5E8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CARMIL2Q6F5E8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CARMIL2Q6F5E8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CARMIL2Q6F5E8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CARMIL2Q6F5E8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CARMIL2Q6F5E8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CARMIL2Q6F5E8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CARMIL2Q6F5E8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CARMIL2Q6F5E8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CARMIL2Q6F5E8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CARMIL2Q6F5E8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CARMIL2Q6F5E8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CARMIL2Q6F5E8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CARMIL2Q6F5E8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CARMIL2Q6F5E8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CARMIL2Q6F5E8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CARMIL2Q6F5E8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CARMIL2Q6F5E8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CARMIL2Q6F5E8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CARMIL2Q6F5E8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CARMIL2Q6F5E8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CARMIL2Q6F5E8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms