Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC9A4Q6AI14 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms