Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms