Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ECM29Q5VYK3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ECM29Q5VYK3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms