Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTJ3

KLHDC7A, Kelch domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC7AQ5VTJ3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHDC7AQ5VTJ3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHDC7AQ5VTJ3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHDC7AQ5VTJ3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHDC7AQ5VTJ3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHDC7AQ5VTJ3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHDC7AQ5VTJ3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHDC7AQ5VTJ3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHDC7AQ5VTJ3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHDC7AQ5VTJ3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHDC7AQ5VTJ3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHDC7AQ5VTJ3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHDC7AQ5VTJ3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHDC7AQ5VTJ3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHDC7AQ5VTJ3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHDC7AQ5VTJ3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHDC7AQ5VTJ3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHDC7AQ5VTJ3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHDC7AQ5VTJ3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHDC7AQ5VTJ3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHDC7AQ5VTJ3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHDC7AQ5VTJ3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHDC7AQ5VTJ3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHDC7AQ5VTJ3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHDC7AQ5VTJ3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHDC7AQ5VTJ3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHDC7AQ5VTJ3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHDC7AQ5VTJ3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHDC7AQ5VTJ3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHDC7AQ5VTJ3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHDC7AQ5VTJ3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHDC7AQ5VTJ3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHDC7AQ5VTJ3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHDC7AQ5VTJ3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHDC7AQ5VTJ3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHDC7AQ5VTJ3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHDC7AQ5VTJ3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHDC7AQ5VTJ3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHDC7AQ5VTJ3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHDC7AQ5VTJ3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHDC7AQ5VTJ3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHDC7AQ5VTJ3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHDC7AQ5VTJ3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHDC7AQ5VTJ3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms