Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC63

GRTP1, Growth hormone-regulated TBC protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRTP1Q5TC63 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRTP1Q5TC63 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRTP1Q5TC63 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms