Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAPCD1Q5SSQ6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms