Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3CD-AS1Q5SR53 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms