Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC158Q5M9N0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms