Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HABP4Q5JVS0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HABP4Q5JVS0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HABP4Q5JVS0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HABP4Q5JVS0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HABP4Q5JVS0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HABP4Q5JVS0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HABP4Q5JVS0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HABP4Q5JVS0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HABP4Q5JVS0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HABP4Q5JVS0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HABP4Q5JVS0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HABP4Q5JVS0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HABP4Q5JVS0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HABP4Q5JVS0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HABP4Q5JVS0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HABP4Q5JVS0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HABP4Q5JVS0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HABP4Q5JVS0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HABP4Q5JVS0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HABP4Q5JVS0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HABP4Q5JVS0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HABP4Q5JVS0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HABP4Q5JVS0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HABP4Q5JVS0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HABP4Q5JVS0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HABP4Q5JVS0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HABP4Q5JVS0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HABP4Q5JVS0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HABP4Q5JVS0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HABP4Q5JVS0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HABP4Q5JVS0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HABP4Q5JVS0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HABP4Q5JVS0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HABP4Q5JVS0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HABP4Q5JVS0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HABP4Q5JVS0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HABP4Q5JVS0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HABP4Q5JVS0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HABP4Q5JVS0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HABP4Q5JVS0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HABP4Q5JVS0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HABP4Q5JVS0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms