Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HERC4Q5GLZ8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERC4Q5GLZ8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms