Protein–RNA interactions for Protein: Q53T94

TAF1B, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1BQ53T94 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TAF1BQ53T94 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1BQ53T94 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms