Protein–RNA interactions for Protein: Q53GA4

PHLDA2, Pleckstrin homology-like domain family A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA2Q53GA4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PHLDA2Q53GA4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms