Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP13A4Q4VNC1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP13A4Q4VNC1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms