Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms