Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC153Q494R4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms