Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3M2

SLC5A9, Sodium/glucose cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A9Q2M3M2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC5A9Q2M3M2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A9Q2M3M2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A9Q2M3M2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A9Q2M3M2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A9Q2M3M2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A9Q2M3M2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A9Q2M3M2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A9Q2M3M2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms