Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MICAQ29983 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MICAQ29983 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MICAQ29983 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MICAQ29983 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MICAQ29983 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MICAQ29983 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MICAQ29983 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MICAQ29983 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MICAQ29983 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MICAQ29983 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MICAQ29983 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MICAQ29983 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MICAQ29983 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MICAQ29983 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MICAQ29983 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MICAQ29983 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MICAQ29983 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MICAQ29983 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MICAQ29983 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MICAQ29983 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MICAQ29983 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MICAQ29983 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MICAQ29983 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MICAQ29983 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MICAQ29983 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MICAQ29983 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MICAQ29983 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MICAQ29983 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MICAQ29983 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MICAQ29983 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MICAQ29983 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MICAQ29983 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MICAQ29983 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MICAQ29983 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MICAQ29983 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MICAQ29983 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MICAQ29983 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MICAQ29983 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MICAQ29983 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MICAQ29983 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MICAQ29983 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MICAQ29983 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MICAQ29983 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MICAQ29983 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MICAQ29983 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MICAQ29983 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MICAQ29983 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MICAQ29983 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MICAQ29983 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MICAQ29983 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MICAQ29983 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MICAQ29983 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MICAQ29983 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MICAQ29983 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MICAQ29983 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MICAQ29983 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MICAQ29983 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MICAQ29983 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MICAQ29983 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MICAQ29983 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MICAQ29983 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MICAQ29983 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MICAQ29983 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MICAQ29983 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MICAQ29983 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MICAQ29983 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MICAQ29983 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MICAQ29983 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MICAQ29983 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MICAQ29983 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MICAQ29983 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MICAQ29983 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MICAQ29983 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MICAQ29983 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MICAQ29983 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MICAQ29983 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MICAQ29983 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MICAQ29983 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MICAQ29983 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MICAQ29983 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MICAQ29983 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MICAQ29983 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MICAQ29983 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MICAQ29983 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MICAQ29983 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MICAQ29983 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MICAQ29983 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MICAQ29983 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MICAQ29983 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MICAQ29983 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MICAQ29983 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MICAQ29983 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MICAQ29983 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MICAQ29983 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MICAQ29983 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MICAQ29983 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MICAQ29983 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MICAQ29983 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MICAQ29983 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms