Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LONRF1Q17RB8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LONRF1Q17RB8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
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