Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPROQ16827 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPROQ16827 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPROQ16827 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
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