Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLPPQ16740 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLPPQ16740 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CLPPQ16740 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLPPQ16740 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLPPQ16740 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CLPPQ16740 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLPPQ16740 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLPPQ16740 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLPPQ16740 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLPPQ16740 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLPPQ16740 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLPPQ16740 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLPPQ16740 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLPPQ16740 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLPPQ16740 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLPPQ16740 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLPPQ16740 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLPPQ16740 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLPPQ16740 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLPPQ16740 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLPPQ16740 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLPPQ16740 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CLPPQ16740 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLPPQ16740 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLPPQ16740 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CLPPQ16740 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLPPQ16740 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLPPQ16740 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLPPQ16740 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CLPPQ16740 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLPPQ16740 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLPPQ16740 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLPPQ16740 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLPPQ16740 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLPPQ16740 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLPPQ16740 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLPPQ16740 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLPPQ16740 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLPPQ16740 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLPPQ16740 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CLPPQ16740 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLPPQ16740 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLPPQ16740 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLPPQ16740 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLPPQ16740 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLPPQ16740 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLPPQ16740 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLPPQ16740 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLPPQ16740 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLPPQ16740 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLPPQ16740 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLPPQ16740 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLPPQ16740 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLPPQ16740 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CLPPQ16740 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLPPQ16740 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CLPPQ16740 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CLPPQ16740 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CLPPQ16740 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLPPQ16740 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLPPQ16740 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLPPQ16740 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLPPQ16740 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLPPQ16740 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLPPQ16740 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLPPQ16740 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLPPQ16740 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLPPQ16740 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CLPPQ16740 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLPPQ16740 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CLPPQ16740 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLPPQ16740 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CLPPQ16740 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLPPQ16740 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CLPPQ16740 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLPPQ16740 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLPPQ16740 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CLPPQ16740 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLPPQ16740 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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