Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
HERC1Q15751 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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HERC1Q15751 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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HERC1Q15751 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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