Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIX1Q15475 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX1Q15475 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
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