Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NECTIN1Q15223 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NECTIN1Q15223 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
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