Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAM2Q15035 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAM2Q15035 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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