Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
IRF5Q13568 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRF5Q13568 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRF5Q13568 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
IRF5Q13568 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRF5Q13568 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
IRF5Q13568 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRF5Q13568 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRF5Q13568 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRF5Q13568 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRF5Q13568 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
IRF5Q13568 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRF5Q13568 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
IRF5Q13568 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IRF5Q13568 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IRF5Q13568 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IRF5Q13568 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRF5Q13568 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRF5Q13568 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRF5Q13568 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRF5Q13568 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRF5Q13568 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRF5Q13568 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRF5Q13568 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRF5Q13568 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRF5Q13568 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRF5Q13568 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRF5Q13568 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
IRF5Q13568 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRF5Q13568 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRF5Q13568 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRF5Q13568 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRF5Q13568 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRF5Q13568 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRF5Q13568 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRF5Q13568 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRF5Q13568 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRF5Q13568 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRF5Q13568 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRF5Q13568 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRF5Q13568 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRF5Q13568 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
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