Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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