Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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