Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIK3Q13003 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK3Q13003 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
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