Protein–RNA interactions for Protein: Q12999

TSPAN31, Tetraspanin-31, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN31Q12999 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TSPAN31Q12999 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSPAN31Q12999 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms