Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC10A2Q12908 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC10A2Q12908 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC10A2Q12908 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC10A2Q12908 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC10A2Q12908 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC10A2Q12908 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC10A2Q12908 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC10A2Q12908 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC10A2Q12908 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC10A2Q12908 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC10A2Q12908 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC10A2Q12908 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC10A2Q12908 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC10A2Q12908 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC10A2Q12908 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC10A2Q12908 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms