Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFFO1Q0D2I5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFFO1Q0D2I5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms