Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD47Q08722 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD47Q08722 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD47Q08722 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD47Q08722 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD47Q08722 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD47Q08722 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD47Q08722 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD47Q08722 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CD47Q08722 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD47Q08722 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD47Q08722 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CD47Q08722 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD47Q08722 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD47Q08722 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CD47Q08722 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD47Q08722 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD47Q08722 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD47Q08722 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD47Q08722 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD47Q08722 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD47Q08722 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD47Q08722 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD47Q08722 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD47Q08722 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD47Q08722 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD47Q08722 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD47Q08722 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD47Q08722 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CD47Q08722 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD47Q08722 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD47Q08722 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD47Q08722 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD47Q08722 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD47Q08722 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD47Q08722 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD47Q08722 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD47Q08722 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD47Q08722 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD47Q08722 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD47Q08722 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD47Q08722 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD47Q08722 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD47Q08722 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD47Q08722 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD47Q08722 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD47Q08722 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD47Q08722 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD47Q08722 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD47Q08722 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD47Q08722 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD47Q08722 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD47Q08722 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD47Q08722 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD47Q08722 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD47Q08722 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD47Q08722 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD47Q08722 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD47Q08722 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD47Q08722 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CD47Q08722 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CD47Q08722 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD47Q08722 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD47Q08722 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD47Q08722 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD47Q08722 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD47Q08722 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD47Q08722 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD47Q08722 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD47Q08722 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD47Q08722 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD47Q08722 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD47Q08722 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD47Q08722 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD47Q08722 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD47Q08722 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD47Q08722 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD47Q08722 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD47Q08722 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD47Q08722 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD47Q08722 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CD47Q08722 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD47Q08722 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD47Q08722 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD47Q08722 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD47Q08722 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD47Q08722 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD47Q08722 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD47Q08722 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CD47Q08722 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD47Q08722 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD47Q08722 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD47Q08722 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD47Q08722 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD47Q08722 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD47Q08722 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD47Q08722 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD47Q08722 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD47Q08722 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD47Q08722 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms