Protein–RNA interactions for Protein: Q08174

PCDH1, Protocadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH1Q08174 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCDH1Q08174 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCDH1Q08174 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCDH1Q08174 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PCDH1Q08174 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PCDH1Q08174 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCDH1Q08174 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCDH1Q08174 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PCDH1Q08174 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCDH1Q08174 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PCDH1Q08174 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PCDH1Q08174 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCDH1Q08174 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PCDH1Q08174 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PCDH1Q08174 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCDH1Q08174 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCDH1Q08174 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCDH1Q08174 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCDH1Q08174 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PCDH1Q08174 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PCDH1Q08174 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCDH1Q08174 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PCDH1Q08174 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCDH1Q08174 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCDH1Q08174 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PCDH1Q08174 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCDH1Q08174 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms