Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDK18Q07002 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK18Q07002 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms