Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAX8Q06710 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAX8Q06710 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAX8Q06710 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAX8Q06710 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAX8Q06710 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAX8Q06710 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAX8Q06710 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAX8Q06710 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAX8Q06710 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAX8Q06710 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAX8Q06710 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAX8Q06710 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAX8Q06710 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAX8Q06710 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAX8Q06710 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PAX8Q06710 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAX8Q06710 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAX8Q06710 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAX8Q06710 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAX8Q06710 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAX8Q06710 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAX8Q06710 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAX8Q06710 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAX8Q06710 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAX8Q06710 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAX8Q06710 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAX8Q06710 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAX8Q06710 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PAX8Q06710 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAX8Q06710 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAX8Q06710 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAX8Q06710 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAX8Q06710 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PAX8Q06710 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAX8Q06710 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAX8Q06710 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAX8Q06710 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAX8Q06710 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAX8Q06710 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAX8Q06710 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms