Protein–RNA interactions for Protein: Q06629

HDA2, HDA1 complex subunit 2, yeastyeast

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA2Q06629 YBL059WYBL059W 582 nt5.46□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 MRPL22YNL177C 930 nt5.46□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 MRPS12YNR036C 462 nt5.46□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 MRPS16YPL013C 366 nt5.46□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 POP7YBR167C 423 nt5.46□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 MRPL27YBR282W 441 nt5.46□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 MNN5YJL186W 1761 nt5.46□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 CTK1YKL139W 1587 nt5.46□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 PFK2YMR205C 2880 nt5.45□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 ENT1YDL161W 1365 nt5.45□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 YEL068CYEL068C 333 nt5.45□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 IKI1YHR187W 930 nt5.45□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 ARC15YIL062C 465 nt5.45□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 RPS5YJR123W 678 nt5.45□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 SDH3YKL141W 597 nt5.45□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 MAP1YLR244C 1164 nt5.45□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 DYN3YMR299C 939 nt5.45□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 IZH2YOL002C 954 nt5.45□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt5.45□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 AVT2YEL064C 1443 nt5.45□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 STB5YHR178W 2232 nt5.44□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 GPA2YER020W 1350 nt5.44□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt5.44□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 PGD1YGL025C 1194 nt5.44□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 MCM6YGL201C 3054 nt5.44□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 FRA2YGL220W 363 nt5.44□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 CAP2YIL034C 864 nt5.44□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 RNR3YIL066C 2610 nt5.44□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 GCD14YJL125C 1152 nt5.44□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 KKQ8YKL168C 2175 nt5.44□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 YLR217WYLR217W 324 nt5.44□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 YMR010WYMR010W 1218 nt5.44□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 NIS1YNL078W 1224 nt5.44□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt5.44□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 MIX23YBL107C 591 nt5.44□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 TRS33YOR115C 807 nt5.44□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 CPA1YOR303W 1236 nt5.44□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 PPT2YPL148C 522 nt5.44□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 YPR012WYPR012W 255 nt5.44□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 RRG8YPR116W 834 nt5.44□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 MRC1YCL061C 3291 nt5.44□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 AMA1YGR225W 1782 nt5.44□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 HSP82YPL240C 2130 nt5.44□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 PHO90YJL198W 2646 nt5.44□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 PTK2YJR059W 2457 nt5.43□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 UTP4YDR324C 2331 nt5.43□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 ERG7YHR072W 2196 nt5.43□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 Q0032Q0032 291 nt5.43□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 YCR101CYCR101C 549 nt5.43□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 RSM28YDR494W 1086 nt5.43□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 GLC7YER133W 939 nt5.43□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 VAM7YGL212W 951 nt5.43□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 YGL242CYGL242C 546 nt5.43□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 SRB5YGR104C 924 nt5.43□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 CAB4YGR277C 918 nt5.43□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 PRS3YHL011C 963 nt5.43□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 THP2YHR167W 786 nt5.43□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 YLR444CYLR444C 303 nt5.43□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 HAP3YBL021C 435 nt5.43□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 CKA2YOR061W 1020 nt5.43□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 SPR2YOR214C 711 nt5.43□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 DGA1YOR245C 1257 nt5.43□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 RRG7YOR305W 729 nt5.43□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 YOR366WYOR366W 354 nt5.43□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 OXR1YPL196W 822 nt5.43□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt5.43□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 YPR114WYPR114W 948 nt5.43□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 HSP104YLL026W 2727 nt5.43□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 ALD6YPL061W 1503 nt5.43□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 PDH1YPR002W 1551 nt5.42□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 IOC4YMR044W 1428 nt5.42□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 VPS5YOR069W 2028 nt5.42□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 YCR085WYCR085W 354 nt5.42□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 SIT4YDL047W 936 nt5.42□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 BMH2YDR099W 822 nt5.42□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 CNN1YFR046C 1086 nt5.42□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 YGL193CYGL193C 312 nt5.42□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 SYF2YGR129W 648 nt5.42□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.42□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.42□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.42□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.42□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.42□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 GIC1YHR061C 945 nt5.42□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 BET4YJL031C 984 nt5.42□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 YKL115CYKL115C 393 nt5.42□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 RHO4YKR055W 876 nt5.42□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 GEP5YLR091W 882 nt5.42□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 RIB4YOL143C 510 nt5.42□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 RIB5YBR256C 717 nt5.42□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 CNE1YAL058W 1509 nt5.42□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 MTH1YDR277C 1302 nt5.42□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 ALG11YNL048W 1647 nt5.41□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 RCR2YDR003W 633 nt5.41□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 OCA6YDR067C 675 nt5.41□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 CBP4YGR174C 513 nt5.41□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 BUD19YJL188C 309 nt5.41□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 MET14YKL001C 609 nt5.41□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 RLP24YLR009W 600 nt5.41□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 FRS2YFL022C 1512 nt5.41□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.2 ms