Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EGR4Q05215 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EGR4Q05215 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EGR4Q05215 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EGR4Q05215 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EGR4Q05215 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EGR4Q05215 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
EGR4Q05215 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EGR4Q05215 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
EGR4Q05215 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
EGR4Q05215 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
EGR4Q05215 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
EGR4Q05215 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
EGR4Q05215 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EGR4Q05215 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EGR4Q05215 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EGR4Q05215 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EGR4Q05215 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EGR4Q05215 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
EGR4Q05215 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EGR4Q05215 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EGR4Q05215 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EGR4Q05215 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EGR4Q05215 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EGR4Q05215 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EGR4Q05215 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EGR4Q05215 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EGR4Q05215 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EGR4Q05215 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EGR4Q05215 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EGR4Q05215 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EGR4Q05215 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms