Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	Q04048	STR2	YJR130C	1920 nt		4.82	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	YHL012W	YHL012W	1482 nt		4.81	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	FBP26	YJL155C	1359 nt		4.81	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	LPP1	YDR503C	825 nt		4.81	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	SAE3	YHR079C-A	276 nt		4.81	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	UPS2	YLR168C	693 nt		4.81	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	SUA7	YPR086W	1038 nt		4.81	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	CDC6	YJL194W	1542 nt		4.81	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	TIF4632	YGL049C	2745 nt		4.81	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	HFA1	YMR207C	6372 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	CDC9	YDL164C	2268 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	SSA2	YLL024C	1920 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	TGL1	YKL140W	1647 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	ALG11	YNL048W	1647 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	KAP114	YGL241W	3015 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	RPL24A	YGL031C	468 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	VMA22	YHR060W	546 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	DPH1	YIL103W	1278 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	SGN1	YIR001C	753 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	YKL071W	YKL071W	771 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	SPC24	YMR117C	642 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	SUI1	YNL244C	327 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	TRM13	YOL125W	1431 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	AGA1	YNR044W	2178 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	GPB1	YOR371C	2694 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	PRR2	YDL214C	2100 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	TPO2	YGR138C	1845 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	CUS1	YMR240C	1311 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	USA1	YML029W	2517 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	MED2	YDL005C	1296 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	YDR056C	YDR056C	618 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	YEL045C	YEL045C	426 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	YHL049C	YHL049C	816 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	GPP1	YIL053W	753 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	AIM26	YKL037W	357 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	MBR1	YKL093W	1020 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	TVP38	YKR088C	1014 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	EMG1	YLR186W	759 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	ORM2	YLR350W	651 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	VPS71	YML041C	843 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	COG5	YNL051W	1212 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	MPD1	YOR288C	957 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	ARC40	YBR234C	1155 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	EGT2	YNL327W	3126 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	VPS28	YPL065W	729 nt		4.78	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	YDC1	YPL087W	954 nt		4.78	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	BRE4	YDL231C	3378 nt		4.78	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	IOC4	YMR044W	1428 nt		4.78	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	BBC1	YJL020C	3474 nt		4.78	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	PRP28	YDR243C	1767 nt		4.78	□□□□□ -1.64
SYF1	Q04048	HRK1	YOR267C	2280 nt		4.77	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	NPL4	YBR170C	1743 nt		4.77	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	MMT1	YMR177W	1533 nt		4.77	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	MET4	YNL103W	2019 nt		4.77	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	DOS2	YDR068W	933 nt		4.77	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	RPB7	YDR404C	516 nt		4.77	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	YFL041W-A	YFL041W-A	192 nt		4.77	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	HMX1	YLR205C	954 nt		4.77	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	YNR061C	YNR061C	660 nt		4.77	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	CTR1	YPR124W	1221 nt		4.77	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	ARX1	YDR101C	1782 nt		4.77	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	MRS2	YOR334W	1413 nt		4.77	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	YDL124W	YDL124W	939 nt		4.76	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	YFR045W	YFR045W	930 nt		4.76	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	YGL199C	YGL199C	471 nt		4.76	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	CPR6	YLR216C	1116 nt		4.76	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	YLR225C	YLR225C	1224 nt		4.76	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	VID22	YLR373C	2706 nt		4.76	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	AVT1	YJR001W	1809 nt		4.76	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	PAF1	YBR279W	1338 nt		4.75	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	BUD30	YDL151C	582 nt		4.75	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	MCM21	YDR318W	1107 nt		4.75	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	YGL101W	YGL101W	648 nt		4.75	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	MNN11	YJL183W	1269 nt		4.75	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	KTR2	YKR061W	1278 nt		4.75	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	JLP1	YLL057C	1239 nt		4.75	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	ASI2	YNL159C	870 nt		4.75	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	ATG8	YBL078C	354 nt		4.75	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	RAD17	YOR368W	1206 nt		4.75	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	snR34	snR34	203 nt		4.75	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	THI20	YOL055C	1656 nt		4.75	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	PUS9	YDL036C	1389 nt		4.75	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	SAC1	YKL212W	1872 nt		4.75	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	FAR8	YMR029C	1572 nt		4.74	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	ELO2	YCR034W	1044 nt		4.74	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	MRP13	YGR084C	1020 nt		4.74	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	MSA2	YKR077W	1092 nt		4.74	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	SEC72	YLR292C	582 nt		4.74	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	PEX12	YMR026C	1200 nt		4.74	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	YNR068C	YNR068C	819 nt		4.74	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	IME4	YGL192W	1803 nt		4.74	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	CYM1	YDR430C	2970 nt		4.74	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	PFK1	YGR240C	2964 nt		4.74	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	MIH1	YMR036C	1665 nt		4.73	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	BSC1	YDL037C	987 nt		4.73	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	YAR030C	YAR030C	342 nt		4.73	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	YLR462W	YLR462W	609 nt		4.73	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	RPS1B	YML063W	768 nt		4.73	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	YPK3	YBR028C	1578 nt		4.73	□□□□□ -1.65
SYF1	Q04048	CTT1	YGR088W	1689 nt		4.73	□□□□□ -1.65

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