Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTN2Q02246 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms