Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms