Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms