Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRCDQ00LT1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms